Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkraQ9WTX2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms