Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms