Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nfe2l3Q9WTM4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nfe2l3Q9WTM4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms