Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms