Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psma4Q9R1P0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms