Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms