Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tpk1Q9R0M5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpk1Q9R0M5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms