Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zeb2Q9R0G7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zeb2Q9R0G7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms