Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms