Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms