Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms