Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tomm40Q9QYA2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tomm40Q9QYA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms