Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx4Q9QY61 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms