Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms