Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn4Q9QXZ9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn4Q9QXZ9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms