Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fscn3Q9QXW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Fscn3Q9QXW4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms