Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms