Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apbb1Q9QXJ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms