Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hacl1Q9QXE0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacl1Q9QXE0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms