Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms