Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyhr1Q9QXA1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms