Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln8Q9QUK3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms