Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc2lQ9JME7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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