Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prg4Q9JM99 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms