Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrfQ9JM73 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrfQ9JM73 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms