Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2l2Q9JLG4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms