Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TefQ9JLC6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms