Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gde1Q9JL56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gde1Q9JL56 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms