Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot9Q9JKY0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms