Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pole3Q9JKP7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms