Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nova1Q9JKN6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms