Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
AtrQ9JKK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms