Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp39a1Q9JKJ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms