Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem1Q9JKE2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms