Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scamp5Q9JKD3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scamp5Q9JKD3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms