Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Uchl3Q9JKB1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms