Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK24

Ppp2r3c, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r3cQ9JK24 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppp2r3cQ9JK24 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ppp2r3cQ9JK24 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms