Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd3Q9JJY3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms