Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zfhx4Q9JJN2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfhx4Q9JJN2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms