Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efcc1Q9JJF6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efcc1Q9JJF6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms