Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Riox1Q9JJF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms