Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc86Q9JJ89 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc86Q9JJ89 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms