Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc22Q9JIG7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms