Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn12Q9ET43 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn12Q9ET43 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms