Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms