Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim2Q9ESN6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim2Q9ESN6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms