Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem27Q9ESG4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem27Q9ESG4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms