Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube3bQ9ES34 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube3bQ9ES34 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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