Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SelenofQ9ERR7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SelenofQ9ERR7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms