Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc28a3Q9ERH8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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